91桃色

STUDIA

biochemia

Rok uko艅czenia:

2003

STOPNIE I TYTU艁Y

Habilitacja

Dziedzina:

nauk biologicznych

Dyscyplina:

biochemia

厂辫别肠箩补濒苍辞艣肠颈:

bioinformatyka, bioinformatyka

Data uzyskania stopnia:

26/09/2017

Tytu艂 pracy:

Instytucja:

Doktorat

Dziedzina:

nauk biologicznych

Dyscyplina:

biochemia

厂辫别肠箩补濒苍辞艣膰:

biochemia krzepni臋cia krwi

Data uzyskania stopnia:

23/10/2007

Tytu艂 pracy:

Instytucja:

26 SEP 2017 Assistant professor with habilitation at the 91桃色, Department of General Biochemistry. habilitation thesis "Application of bioinformatics and computational chemistry in the study of evolution and biochemical processes of serine proteases of blood coagulation and fibrinolysis".

1 OCT 2008 Assistant professor at the 91桃色, Department of General Biochemistry.

11 APR - 11 JUL 2008 EMBO Short-Term Fellowship (ASTF 83.00-2008) at the University of California, San Diego.

1 DEC 2007 Research associate at the 91桃色, Department of General Biochemistry.

23 OCT 2007 PH.D degree in biochemistry - doctorate thesis: "Changes of fibrinogen coagulation properties induced by reactive nitrogen and oxygen species" .

Wielkie pytanie o 偶ycie, wszech艣wiat i ca艂膮 reszt臋?

Zainteresowania naukowe:

Biologia strukturalna bia艂ek hemostazy - CryoEM, a przede wszystkim uk艂adu kontaktu i kininogenezy z u偶yciem techniki mikroskopii krioelektronowe 鈥損oznawanie struktury kininogen贸w. Ewolucja molekularna, filogenetyka, modelowanie molekularne, dokowanie, dynamika i bioinformatyka w dziedzinie biochemii bia艂ek hemostazy i projektowania lek贸w, ze szczeg贸lnym uwzgl臋dnieniem znaczenia proteaz kontaktu (FXI, FXII, PK) w chorobach zakrzepowych. Symulacje wi膮zania ligand贸w z bia艂kami - dokowanie molekularne. Przewidywanie strukturalne, modelowanie, dynamika molekularna i inne analizy bia艂ek. Przewidywanie prawdopodobie艅stwa wyst膮pienia lek贸w. Molekularne mechanizmy zmian wywo艂anych stresem oksydacyjnym w bia艂kach uk艂adu krzepni臋cia krwi.

Ultimate Question of Life, the Universe, and Everything

Scientific research interests:

Structural biology of proteins of hemostatic proteins CryoEM, and above all the contact system and kininogenesis system using the technique of cryogenic transmission electron microscopy (CryoEM) - studying the structure of kininogens. Docking ligands in the search for new drugs and learning about protein functions. Molecular evolution, phylogenetics, molecular modelling, docking, dynamics and bioinformatics in the field of biochemistry of proteins of hemostasis and drug design, with particular emphasis on the importance of contact proteases (FXI, FXII, PK) in thrombotic diseases. Simulations of ligand binding to proteins - molecular docking. Structural prediction, modelling, molecular dynamics and other analyses of proteins. Drug likeliness prediction. Molecular mechanisms of modifications caused by oxidative stress in proteins of blood coagulation system.

Najnowsze publikacje:

High Molecular Weight Kininogen: A Review of the Structural Literature by Micha艂 B. Ponczek. Int. J. Mol. Sci. 2021, 22(24), 13370;
Otrzymano: 29 pa偶dziernik 2021 / Zrecenzowano: 2 grudzie艅 2021 / Zaakceptowano: 11 grudzie艅 2021 / Opublikowano: 13 grudzie艅 2021

Finding inhibitors for PCSK9 using computational methods. Rida Zainab,Afshan Kaleem ,Micha艂 B. Ponczek ,Roheena Abdullah,Mehwish Iqtedar,Daniel C. Hoessli. Opublikowane: 5 sierpnie艅, 2021

Naukowe wizyty zagraniczne

• Visiting Scholar, Czerwiec 2019 - lipiec 2019, Department of Pathology, Microbiology and Immunology, Nashville, USA

• Postdoctoral Fellow, EMBO Short-Term Fellowship ASTF 83.00-2008, kwiecie艅 2008 - czerwiec 2008, Department of Chemistry and Biochemistry, San Diego, USA